呼吸道感染是一种非常常见的疾病，一般分为上呼吸道感染和下呼吸道感染，临床症状相似，但引起呼吸道感染的病原体种类繁多而且复杂，有病毒、细菌、真菌、支原体、衣原体和原虫等，尽快锁定病原体种类，有利于对症下药。

呼吸道感染病原体复杂易变

呼吸道病原体也是世界上历次重大传染病疫情的元凶之一，包括1918年西班牙大流感、1956年H3N2香港流感、1972年H2N2流感、1968年流感等。近20年来，出现了SARA、H5N1禽流感、H1N1(2009)、H7N9禽流感和中东呼吸综合征（MERS）等多种以呼吸道感染为主要表现的新发传染病。

由于呼吸道传染病具有临床表现相似、突发性、不确定性、传播快、危害大以及病原体种类多和临床难以鉴别诊断等特点，严重威胁百姓健康、社会安定，甚至国家安全，是我国乃至全球传染病预防控制的难点。

呼吸道病原体须早诊早治早防

由于呼吸道感染可危及各年龄段的人群，而且所有人都易感，尤其是婴幼儿、老年人和患有各种慢性病或者体质虚弱的人员呼吸道病原体感染后，如不能及时明确病原体，采取有针对性的治疗措施，很容易出现严重的并发症，具有较高的病死率。因此，快速、方便和高通量的呼吸道病原体检测和筛查方法及技术，对达到“检得出、检得快、检得准”的目标，满足呼吸道感染的早诊早治和早防，应对传染病疫情防控和处置的要求，具有非常重要的意义。

发展高通量快速检测迫在眉睫

通过建立基于分子生物学、免疫学和分离培养的多层次快速高通量呼吸道病原体组合检测技术，可以开展对引起呼吸道感染多达近40余种的病原快速检测和筛查，不仅能快速对已知病原体进行筛选，而且还能及时发现新型呼吸道病原体。

上海市疾控中心病原生物检定所建立了一个呼吸道病原体高通量、快速实验室检测技术平台，它涵盖一系列实验室检测技术：首先，针对人副粘病毒属的共有序列简并杂合寡核苷酸引物，形成一种适用于未知病原体检测的新兴技术；研发覆盖所有甲型流感病毒亚型的基因芯片技术；创立了多种呼吸道致病菌高通量快速检测方法；开发15种嗜肺军团菌血清型的诊断血清和诊断抗原。

其次，提出基于流行病学特征——临床症状——病原体组合检测技术的三维立体诊断流程。通过结合不同学科和技术综合分析形成初步假设，有针对性地采样和检测，实现关口前移，具有敏感性高、时效性强、针对群体样本等特征。

第三，国内首先开发时间——地区——气象因素的流感流行预测模型，首次从模型上解释了上海市甲型流感双峰流行的原因，预测模型已用于在上海市举办的大型活动的风险评估。其应用前景广泛，可推广至长三角乃至整个南方地区，达到和满足呼吸道感染和传染病防控“快速、准确、灵活、全面”的要求。